Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGTAO43765 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGTAO43765 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms