Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAB2O43741 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms