Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTSS1O43312 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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