Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARPC5O15511 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARPC5O15511 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARPC5O15511 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARPC5O15511 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARPC5O15511 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARPC5O15511 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARPC5O15511 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARPC5O15511 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARPC5O15511 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms