Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms