Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYNMO15061 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYNMO15061 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYNMO15061 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNMO15061 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNMO15061 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNMO15061 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNMO15061 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYNMO15061 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYNMO15061 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms