Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EBAG9O00559 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms