Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms