Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCER2I3L3R5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms