Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H7C417 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H7C417 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
H7C417 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H7C417 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H7C417 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms