Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TVP23AA6NH52 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms