Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PALM3A6NDB9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms