Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL33A6NCF5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms