Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC162PA2VCL2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms