Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF2Q9Y5W3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF2Q9Y5W3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms