Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KIF3AQ9Y496 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KIF3AQ9Y496 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KIF3AQ9Y496 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms