Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3BP1Q9Y3L3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3BP1Q9Y3L3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms