Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NINLQ9Y2I6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NINLQ9Y2I6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NINLQ9Y2I6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NINLQ9Y2I6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NINLQ9Y2I6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms