Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHKBQ9Y259 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHKBQ9Y259 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHKBQ9Y259 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms