Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA8BQ9ULN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA8BQ9ULN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNMA8BQ9ULN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.4 ms