Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IKZF3Q9UKT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IKZF3Q9UKT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IKZF3Q9UKT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms