Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXL3Q9UKT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXL3Q9UKT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FBXL3Q9UKT7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FBXL3Q9UKT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms