Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HACL1Q9UJ83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HACL1Q9UJ83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HACL1Q9UJ83 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HACL1Q9UJ83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HACL1Q9UJ83 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30■■■□□ 2.39
HACL1Q9UJ83 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HACL1Q9UJ83 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HACL1Q9UJ83 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms