Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAX2Q9UIW0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAX2Q9UIW0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms