Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCOCQ9UIL1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCOCQ9UIL1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCOCQ9UIL1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCOCQ9UIL1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms