Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN3Q9UHW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN3Q9UHW5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1020.3 ms