Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPASTQ9UBP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPASTQ9UBP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPASTQ9UBP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPASTQ9UBP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms