Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCD2Q9UBJ2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABCD2Q9UBJ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms