Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3BP4Q9P0V3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BP4Q9P0V3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4Q9P0V3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4Q9P0V3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms