Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIM2Q9NZV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIM2Q9NZV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZIM2Q9NZV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIM2Q9NZV7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms