Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKD2L2Q9NZM6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L2Q9NZM6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L2Q9NZM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PKD2L2Q9NZM6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms