Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ING3Q9NXR8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ING3Q9NXR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms