Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBRD1Q9NUN5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBRD1Q9NUN5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMBRD1Q9NUN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD1Q9NUN5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms