Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PDLIM7Q9NR12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM7Q9NR12 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM7Q9NR12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM7Q9NR12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms