Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVMER34-1Q9H9K5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVMER34-1Q9H9K5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms