Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZNF408Q9H9D4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZNF408Q9H9D4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZNF408Q9H9D4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF408Q9H9D4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZNF408Q9H9D4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZNF408Q9H9D4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms