Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL1Q9BYD6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL1Q9BYD6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL1Q9BYD6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL1Q9BYD6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms