Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MAP1LC3CQ9BXW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms