Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D1Q9BX74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TM2D1Q9BX74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TM2D1Q9BX74 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms