Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JAM3Q9BX67 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JAM3Q9BX67 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JAM3Q9BX67 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms