Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM109Q9BVC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM109Q9BVC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM109Q9BVC6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM109Q9BVC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms