Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CRB3Q9BUF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRB3Q9BUF7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms