Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTA3Q9BTC8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MTA3Q9BTC8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MTA3Q9BTC8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MTA3Q9BTC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms