Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRACR2AQ9BSW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRACR2AQ9BSW2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRACR2AQ9BSW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms