Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIKE1Q9BRV8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIKE1Q9BRV8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIKE1Q9BRV8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIKE1Q9BRV8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms