Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MGME1Q9BQP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MGME1Q9BQP7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MGME1Q9BQP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MGME1Q9BQP7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MGME1Q9BQP7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MGME1Q9BQP7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms