Protein–RNA interactions for Protein: Q99704

DOK1, Docking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOK1Q99704 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DOK1Q99704 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DOK1Q99704 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DOK1Q99704 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DOK1Q99704 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DOK1Q99704 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DOK1Q99704 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DOK1Q99704 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DOK1Q99704 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms