Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHP1Q99653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHP1Q99653 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHP1Q99653 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHP1Q99653 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHP1Q99653 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms