Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3RQ99062 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3RQ99062 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms