Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMF1Q96S06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMF1Q96S06 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMF1Q96S06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms